疾控中心排放的污水大概可以分為四類型，第一種是傳染病菌廢水，常見的有腸道病菌、病毒以及結核桿菌等廢水；第二種是放射性廢水，這類廢水的成分中都是含有放射性元素；第三種是職工的排放的生活廢水，比如說職工盥洗、廚房以及上廁所時產生的廢水；第四種是一般帶病菌的廢水，通常指腸道病菌污水和醫療器械的洗滌污水。醫院污水主要是指醫院或其他醫療機構的診療室、化驗室、病房、洗衣房、X光片照相室和手術室等排放的污水。由于其特殊性,醫院污水中含有多種致病菌、病毒、*卵和一些有毒有害物質、放射性污染物等，具有很強的傳染性。
尤其是傳染病醫院的污水更是含有大量的病原性微生物、病毒及有毒有害物質。以處理起來就要格外的注意。污水中含有大量較大的懸浮物和漂浮物,格柵的作用是截留并去除上述物質，對水泵和后續處理單元起保護作用。格柵井位于提升井的正上方,采用鋼砼結構與調節池臺建一體,格柵井的上方建有格柵間一座，防止柵渣傳播病毒,為協調周圍環境，可對格柵井外面作美化處理。操作人員可定期對柵渣消毒、清理、外運,作為醫療垃圾焚燒掉。為減輕操作人員的勞動強度，和改善工作環境,保證污水除渣的效果，格柵井內設置1臺機械格柵和1臺提籃格柵。
機械格柵和提籃格柵采用不銹鋼材料制成，具有耐腐蝕,機械格柵自動從污水中清理柵渣,管理方便，故障少、維修率低。洗相廢水主要來自放射科照片洗印，其中含有的污染物質主要是顯影劑、定影劑和漂白劑等。 此外，還含有來自于定影液中的銀，可進行回收利用。 銀的回收方法有電解提銀法和化學沉淀法，低濃度含銀廢水也可采用離子交換法和活性炭吸附法處理。含廢水主要來自各種口腔門診和計測儀器儀表中使用的。 的危害極大，進入水體后可轉化為有機，并通過食物鏈的富集濃縮。 含廢水處理方法包括鐵屑還原法、化學沉淀法、活性炭吸附法和離子交換法。厭氧-缺氧-好氧交替的環境下，活性污泥中除了以氧為電子受體的聚磷菌PAO外，還存在一種反硝化聚磷菌（DPB）。DPB能在缺氧條件下以硝酸鹽為電子受體，在進行反硝化脫氮反應的同時進行過量磷的攝取，從而使攝取磷和反硝化脫氮兩個傳統觀念認為互相矛盾的過程能夠在同一反應池內完成。
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